Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms