Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PgrQ00175 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PgrQ00175 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PgrQ00175 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PgrQ00175 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PgrQ00175 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PgrQ00175 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PgrQ00175 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PgrQ00175 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PgrQ00175 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PgrQ00175 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PgrQ00175 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PgrQ00175 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PgrQ00175 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PgrQ00175 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PgrQ00175 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PgrQ00175 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PgrQ00175 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PgrQ00175 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PgrQ00175 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PgrQ00175 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PgrQ00175 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PgrQ00175 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PgrQ00175 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PgrQ00175 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PgrQ00175 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PgrQ00175 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PgrQ00175 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PgrQ00175 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PgrQ00175 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PgrQ00175 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PgrQ00175 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PgrQ00175 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PgrQ00175 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PgrQ00175 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms