Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp10Q000W5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gbp10Q000W5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms