Protein–RNA interactions for Protein: P98063

Bmp1, Bone morphogenetic protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp1P98063 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bmp1P98063 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms