Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33aP97950 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33aP97950 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms