Protein–RNA interactions for Protein: P97861

Krt86, Keratin, type II cuticular Hb6, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt86P97861 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt86P97861 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt86P97861 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt86P97861 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt86P97861 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt86P97861 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt86P97861 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms