Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bop1P97452 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bop1P97452 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bop1P97452 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bop1P97452 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bop1P97452 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bop1P97452 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bop1P97452 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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