Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms