Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psme1P97371 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Psme1P97371 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psme1P97371 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psme1P97371 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psme1P97371 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psme1P97371 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psme1P97371 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psme1P97371 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psme1P97371 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Psme1P97371 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psme1P97371 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psme1P97371 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psme1P97371 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Psme1P97371 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psme1P97371 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psme1P97371 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Psme1P97371 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Psme1P97371 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psme1P97371 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Psme1P97371 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psme1P97371 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psme1P97371 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psme1P97371 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Psme1P97371 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psme1P97371 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psme1P97371 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Psme1P97371 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Psme1P97371 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psme1P97371 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psme1P97371 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme1P97371 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms