Protein–RNA interactions for Protein: P97326

Cdh6, Cadherin-6, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh6P97326 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh6P97326 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms