Protein–RNA interactions for Protein: P84084

Arf5, ADP-ribosylation factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf5P84084 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf5P84084 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms