Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgcgP82348 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SgcgP82348 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SgcgP82348 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcgP82348 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcgP82348 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcgP82348 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcgP82348 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcgP82348 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcgP82348 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms