Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms