Protein–RNA interactions for Protein: P80316

Cct5, T-complex protein 1 subunit epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct5P80316 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cct5P80316 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cct5P80316 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms