Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ldb1P70662 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms