Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp9xP70398 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp9xP70398 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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