Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeboxP70368 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms