Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx3P70354 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx3P70354 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msx3P70354 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx3P70354 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx3P70354 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx3P70354 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms