Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54lP70270 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms