Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Snrpd1P62315 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms