Protein–RNA interactions for Protein: P62192

Psmc1, 26S proteasome regulatory subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc1P62192 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmc1P62192 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms