Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg6P61406 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg6P61406 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg6P61406 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg6P61406 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smg6P61406 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg6P61406 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms