Protein–RNA interactions for Protein: P61089

Ube2n, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2nP61089 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2nP61089 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms