Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube2d1P61080 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms