Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms