Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3eP60229 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms