Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms