Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpaP58389 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpaP58389 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpaP58389 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpaP58389 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpaP58389 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpaP58389 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpaP58389 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpaP58389 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpaP58389 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtpaP58389 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpaP58389 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpaP58389 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtpaP58389 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpaP58389 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpaP58389 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpaP58389 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpaP58389 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpaP58389 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpaP58389 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpaP58389 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms