Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smpdl3bP58242 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms