Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
GferP56213 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GferP56213 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GferP56213 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
GferP56213 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GferP56213 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GferP56213 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GferP56213 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GferP56213 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
GferP56213 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GferP56213 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GferP56213 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GferP56213 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GferP56213 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GferP56213 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GferP56213 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GferP56213 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GferP56213 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GferP56213 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GferP56213 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GferP56213 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GferP56213 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GferP56213 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GferP56213 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GferP56213 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GferP56213 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GferP56213 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GferP56213 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GferP56213 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GferP56213 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GferP56213 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GferP56213 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
GferP56213 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
GferP56213 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GferP56213 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GferP56213 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GferP56213 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GferP56213 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GferP56213 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GferP56213 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GferP56213 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GferP56213 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GferP56213 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GferP56213 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GferP56213 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GferP56213 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GferP56213 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GferP56213 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GferP56213 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GferP56213 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GferP56213 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GferP56213 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GferP56213 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GferP56213 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GferP56213 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GferP56213 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GferP56213 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GferP56213 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GferP56213 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GferP56213 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GferP56213 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GferP56213 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GferP56213 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms