Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms