Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtskP55097 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtskP55097 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CtskP55097 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtskP55097 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtskP55097 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtskP55097 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtskP55097 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtskP55097 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtskP55097 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtskP55097 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtskP55097 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms