Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms