Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a1P55014 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms