Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PctpP53808 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PctpP53808 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PctpP53808 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PctpP53808 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PctpP53808 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PctpP53808 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PctpP53808 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PctpP53808 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PctpP53808 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PctpP53808 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PctpP53808 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PctpP53808 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PctpP53808 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PctpP53808 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PctpP53808 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PctpP53808 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PctpP53808 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PctpP53808 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PctpP53808 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PctpP53808 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PctpP53808 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PctpP53808 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PctpP53808 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PctpP53808 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PctpP53808 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PctpP53808 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PctpP53808 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PctpP53808 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PctpP53808 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PctpP53808 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PctpP53808 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PctpP53808 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PctpP53808 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PctpP53808 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PctpP53808 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PctpP53808 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PctpP53808 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PctpP53808 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PctpP53808 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PctpP53808 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PctpP53808 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PctpP53808 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PctpP53808 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PctpP53808 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PctpP53808 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PctpP53808 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PctpP53808 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PctpP53808 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PctpP53808 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PctpP53808 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PctpP53808 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PctpP53808 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PctpP53808 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PctpP53808 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PctpP53808 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PctpP53808 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PctpP53808 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PctpP53808 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PctpP53808 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PctpP53808 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PctpP53808 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PctpP53808 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PctpP53808 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PctpP53808 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms