Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms