Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pold1P52431 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pold1P52431 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms