Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcnfP51944 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnfP51944 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnfP51944 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnfP51944 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnfP51944 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnfP51944 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnfP51944 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnfP51944 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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