Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LtbrP50284 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LtbrP50284 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LtbrP50284 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LtbrP50284 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbrP50284 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbrP50284 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbrP50284 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbrP50284 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbrP50284 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms