Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms