Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpreP49446 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
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