Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CitP49025 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CitP49025 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CitP49025 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CitP49025 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CitP49025 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CitP49025 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CitP49025 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CitP49025 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CitP49025 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CitP49025 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CitP49025 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CitP49025 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CitP49025 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CitP49025 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CitP49025 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CitP49025 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CitP49025 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CitP49025 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CitP49025 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CitP49025 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CitP49025 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CitP49025 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CitP49025 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CitP49025 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CitP49025 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CitP49025 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CitP49025 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CitP49025 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CitP49025 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CitP49025 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CitP49025 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CitP49025 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CitP49025 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CitP49025 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CitP49025 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CitP49025 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CitP49025 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CitP49025 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CitP49025 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CitP49025 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CitP49025 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CitP49025 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CitP49025 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms