Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms