Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms