Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VdrP48281 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VdrP48281 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VdrP48281 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VdrP48281 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VdrP48281 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VdrP48281 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VdrP48281 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VdrP48281 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VdrP48281 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VdrP48281 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VdrP48281 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VdrP48281 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VdrP48281 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VdrP48281 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VdrP48281 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VdrP48281 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VdrP48281 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VdrP48281 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VdrP48281 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VdrP48281 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VdrP48281 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VdrP48281 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VdrP48281 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VdrP48281 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VdrP48281 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VdrP48281 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VdrP48281 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VdrP48281 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VdrP48281 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VdrP48281 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VdrP48281 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VdrP48281 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VdrP48281 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VdrP48281 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VdrP48281 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VdrP48281 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VdrP48281 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VdrP48281 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VdrP48281 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VdrP48281 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VdrP48281 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VdrP48281 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VdrP48281 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VdrP48281 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VdrP48281 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VdrP48281 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VdrP48281 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VdrP48281 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VdrP48281 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VdrP48281 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VdrP48281 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VdrP48281 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VdrP48281 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VdrP48281 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VdrP48281 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VdrP48281 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VdrP48281 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VdrP48281 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VdrP48281 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VdrP48281 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms