Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TgfaP48030 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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