Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl5P47962 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl5P47962 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl5P47962 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl5P47962 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl5P47962 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl5P47962 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl5P47962 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl5P47962 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl5P47962 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl5P47962 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl5P47962 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl5P47962 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl5P47962 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl5P47962 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl5P47962 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl5P47962 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl5P47962 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl5P47962 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl5P47962 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl5P47962 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl5P47962 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl5P47962 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl5P47962 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl5P47962 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl5P47962 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms