Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Resp18P47939 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Resp18P47939 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Resp18P47939 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Resp18P47939 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Resp18P47939 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Resp18P47939 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Resp18P47939 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Resp18P47939 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms