Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rab11bP46638 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rab11bP46638 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rab11bP46638 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rab11bP46638 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rab11bP46638 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab11bP46638 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rab11bP46638 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Rab11bP46638 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Rab11bP46638 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Rab11bP46638 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rab11bP46638 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rab11bP46638 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rab11bP46638 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rab11bP46638 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rab11bP46638 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rab11bP46638 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rab11bP46638 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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