Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms